首先你要了解这两个专业的所属范畴及对应的就业接口。
人工搬运一下：
工业设计（Industrial Design），简称ID。指以工学、美学、经济学为基础对工业产品进行设计。 工业设计分为产品设计、环境设计、传播设计、设计管理4类；包括造型设计、机械设计、电路设计、服装设计、环境规划、室内设计、建筑设计、UI设计、平面设计、包装设计、广告设计、动画设计、展示设计、网站设计等。工业设计又称工业产品设计学，工业设计涉及到心理学，社会学，美学，人机工程学，机械构造，摄影，色彩学等
机械设计及其自动化专业培养具备机械设计制造基础知识与应用能力，能在工业生产第一线从事机械制造领域内的设计制造、科技开发、应用研究、以机械设计与制造为基础，融入 计算机科学、 信息技术、自动控制技术的交叉学科，主要任务是运用先进设计制造技术的理论与方法，解决现代工程领域中的复杂技术问题，以实现产品智能化的设计与制造。
两种专业其所包含的都是多种多样，就业方向也是千差万别。
工业设计本身都没有一个准确的定义，因其涉及面太广，知识较为宽泛很难达成一个共识。
工业设计是结合工业与美学，不单纯的是一门学科，与机械设计及其自动化是两门差异性很大的专业。
工业设计的就业方向主要是1.去工业设计公司，对产品进行外观造型设计，利用所学对产品的造型及外观进行新的定义，一般需要你会使用一种3D建模软件如犀牛，一种渲染软件如VRay，也有建模与渲染一体的3DMax，一种平面处理图像软件PS /AI，而这些是一个工业设计师必备的技能，当然你还需要有良好的手绘能力，包括素描，产品效果图的绘制。
2.可以去互联网公司做UI，这个也是工业设计的范畴，产品用户交互设计应该是工业设计的一个好的方向，并且是很有前途。
3.做平面设计，涉及的公司比较多了，基本上公司的品牌策划都会需要，这个方向也是不错的。主要设计的一些公司logo设计，企业宣传设计及包装设计等等。
4.广告设计及策划，这个专业方向也
是蛮不错的，就业前景及待遇也是可观的。
5.你也可以去做机械设计，但是这个可能就比较棘手，工业设计所学课程与机械设计有很大差异，除了一些基本的工程力学，机械设计原理，其它很多学科你要自学。
机械设计及其自动化的就业方向就不同与工业设计机械设计基本都在工业设备这样的企业如在工业生产第一线（各种机械厂，比如三一重工、徐州重工，还有一些汽车制造厂）从事机械制造领域内的设计制造、科技开发、应用研究、运行管理和经营销售等方面工作，发动机设计、机械设计、模具设计、设备维护、生产管理、销售等.
好的方向非标自动化设计，这个方向比较锻炼人也需要牛人，你首先要把工业3D软件精通如常用的solidworks，或者UG/PROE，而且要精通各种理论计算，会进行标准件的选型计算，包括电机减速机选型，当然你还要有相当的行业经验，机械这行经验相当重要。
另外还可以从事电气控制方面的工作，做编程写软件，这些工作比起机械设计要好的多，而且福利待遇更佳。
其实工业设计跟机械设计及其自动化差的蛮多的，不是可以随便就切换的，首先看你的爱好，你喜欢哪一方面多一些，以兴趣选职位。
每个专业做的好的人都很多，也都取得很大的成就，选好方向是第一步，接下来的路子一定要稳不能急于求成，稳扎稳打。
喜欢哪一行就选哪一行，自己一旦做了选择就坚持走下去，一定会有好的回报。
加油！！！